A mí me pasa también en muchos juegos. Opino también en la línea de Morkai, creo que es más por el tipo de cartón que por el posible peso que tengan encima, porque tengo juegos en la misma situación que comenta, que sin tener peso encima, también se han abombado.
Lo que sí evito siempre es poner juegos de cierto peso y más pequeños encima de juegos con cajas más grandes, porque al final eso sí que abomba la tapa hacia el interior con el paso del tiempo. Intento poner siempre cajas de tamaños similares, con las más pesadas abajo y las menos pesadas encima, y evito poner más de 4 cajas en una misma pila.