Pues eso, he visto por ahí que existen varios sistemas creados para poder jugar en modo solitario al Memoir 44 pero quería saber si alguno los habéis probado y podéis comentar cuál es el que más os convence. Gracias.

Viendo que nadie te contesta, mira lo que se encuentra uno buscando un poco...:

http://labsk.net/index.php?topic=25299.0

https://cdn.daysofwonder.com/uploads/userpages/272628/_1072.pdf

http://www.boardgamegeek.com/file/info/21554

De nada. 

Y que tal funciona en solitario?

Veo que esta variante podria llevarse a los C&C no?

Me he estado mirando las reglas que comentáis y por lo que veo, únicamente indican como se deben seleccionar las cartas.
Pero una vez seleccionada la carta, ¿qué unidades deben realizar la acción y hacia dónde y contra quién?

A las de C&C veo que les pasa lo mismo
https://www.commandsandcolors.net/ancients/the-game/main/variants/117-solo-play/576-cca-solitare-rules.html

Siempre con sentido común y actuando del modo mas beneficioso para el contrario en su turno.