1. Robas 3 cartas

Pero, si él ya robó las 5 cartas pertinentes antes de leer la preparación y tenía su mano preparada.....
Supongo que, si luego te pone que debes comenzar con 3, deberías volver a meter en el mazo (y barajar) 2 de las 5 que tienes en la mano. Así es como yo lo haría...

1. Robas 3 cartas
2. Quitas debilidades y robas tantas cartas como debilidades has descartado.
2b. Si te ha vuelto a salir alguna debilidad repites el paso 2.
3. Descartas tantas cartas como quieras de las 3 que tienes y robas el mismo número de cartas.
4. Quitas debilidades y robas tantas cartas como debilidades has descartado.
4b. Si te ha vuelto a salir alguna debilidad repites el paso 4.
5. Barajar junto al mazo todas las cartas descartas en los pasos anteriores.

PD. Todo esto suponiendo que no tengas nada que haga que tu mano inicial sea diferente de 5 cartas.

Esa "o" debería ser un "ni". Vamos, que no debe haber Progenies en juego ni puestas aparte.