¿qué regulación/reglamentación introduciriamos a esto?,

No hay mucha regulación que ponerle.
Es tan sencillo como
a) asociaciones fundadoras, las que quieras reunirse a ese efecto. Entre todas, 1 asociación=1 voto, se elige al consejo directivo (corto en principio como los objetivos al principio).

 ¿como evitar qué no terminase convertido en un chiringuito de editoriales y distribuidoras?.

Pues no veo como hacer que se termine convirtiendo en un chiringuito de nadie, a no ser que los votantes, las asociaciones formantes de la federación de asociaciones, se conviertan. Las federaciones tienen un principio de democracia.

Es cierto que la federación necesitaría algún tipo de patrocinio, de editoriales y o tiendas, así como buscarían la complicidad de organismos públicos tanto a nivel nocional como a nivel local. No sólo patrocinadores tipo editoriales. También se pueden buscar otro tipo de patrocinadores de entes o empresas vinculados con la juventud, o con el ocio sano, por ejemplo.

En cualquier caso un posible patrocinio, por poner un ejemplo de Devir (es sólo el primer ejemplo que me viene a la cabeza) no tendría más implicación que en la documentación o cartelería o actividades apareciese P

 "Patrocinadores de la Federación Española de Juegos de Mesa:......, x, y, Devir, z"

No veo en que parte lo convierte eso en un chiringuito.