En simulación de vuelo solemos usar TeamSpeak, por el uso de canales y calidad de sonido, pero tiene el problema de necesitar un buen servidor para juntar a mucha gente. Antes se usaba Roger Wilco, pero mejor ni nombrarlo a estas alturas de siglo.
Ventrilo es más para sesiones masivas, pero consume más linea y CPU, y es usado por gente que juega Counterstrike, WoW y similares.
La ventaja principal frente a Skype es que entras a "una sala", donde puede estar la gente sin necesidad de tener que estar llamando, como en Skype, y que no tienes que saber el nick de los otros usuarios para poder hablar con ellos.
Dicho de otro modo: es una sala de chat de voz.