Hacerlo solo con la impresora no siempre es sencillo, imprime las impares por un lado y las pares por el otro, pero ojo, cuando des la vuelta al papel tendrás que cambiar el orden de impresión, ya que sino no te van a coincidir el 1 con el 2, es decir, dile a la impresora que imprima las hojas 1, 3, 5 primero, y luego 6, 4, 2 (también hay una opción que es invertir que hace lo mismo, pero no sé si lo tienen todas las impresoras)
Ten en cuenta también los margenes que deja la impresora a un lado y otro, si ves que es mayor en uno de los lados, cuando imprimas por el otro no te va a coincidir ni de coña... solución: mide ese margen y mediante regla y cutter corta el otro lado hasta dejarlo exactamente igual.
Yo te aconsejo que abras el archivo en Photoshop, adaptas el tamaño que te parezca conveniente para cada página y luego en una plantilla tamaño A4 colocas las impares por un lado y las pares por otro para que coincidan adecuadamente mediante guías...
PD: Creo que esto sería más adecuado mandarlo a la sección manualidades.