Creo que hay una cosa que te puede ayudar a elegir: Batallas de Poniente es para 2 jugadores y Juego de Tronos 2ª Ed. es para 3-6. Quiero decir con esto que si tienes los dos nunca vas a "tener que elegir", ya que, dependiendo de los que estéis, podréis (o tendéis que) jugar a uno o a otro.
En cuanto al sistema de reglas, no tienen nada que ver entre ellos.