La historia transcurre en una Asia distópica sin fronteras subyugada por el dictador khaan, un secuaz de este llamado kiran halló una manera para materializar los monstruos salidos de las pesadillas de los niños para así mantener aterrorizada y controlada a la población, sólo Krai un disidente conocido como El Codificador, con la habilidad de controlar el código del ADN plantó cara a Khaan y sus secuaces, tras varias décadas de lucha Krai finalmente fue apresado y dividido en siete partes que fueron escondidas ya que su cuerpo resistía a la cremación.
Cuatro héroes conocidos como los Code Hunters son los únicos capaces de ver las cadenas ADN suspendidas, el código oscuro, de los demonios cuando estos se materializan, sin embargo sin la ayuda de Krai su lucha contra Khaan y sus secuaces para destruir el código oscuro es imposible.
